Viljeltyjen kalojen rehussa on oltava merkittäviä määriä (35–50 prosenttia) erittäin sulavia proteiineja ja korkealaatuisten rasvojen avulla runsaasti energiaa, jotta voidaan säilyttää niiden aktiivisuus ja kasvu. Tällaisten vesifaasien valmistukseen käytettävissä olevat raaka-aineet ovat peräisin kolmesta päälähteestä:
I) vehnästä, soijasta ja maissista saatavat kasvituotteiden sivutuotteet.
II) Kalajauho ja kala- ja meriäyriäisistä saatu öljy, vaikka niiden osuus rehusta on pienenemässä.
III) Joissakin tapauksissa myös maaeläintuotannon sivutuotteet, jotka ovat erittäin ravitsevia.
Nykyisin edistetään kestäviä ruokintajärjestelmiä, joilla rajoitetaan riippuvuutta luonnonvaraisista kannoista peräisin olevasta kalajauhosta ja kalaöljystä elintarviketuotannossa esimerkiksi kannustamalla käyttämään vaihtoehtoisia proteiiniainesosia, kuten leviä tai hyönteisiä, tai muilta teollisuudenaloilta peräisin olevaa jätettä. Tämä näkyy myös kestävämpää ja kilpailukykyisempää EU:n vesiviljelyä koskevissa strategisissa suuntaviivoissa vuosiksi 2021–2030.