Foder til opdrættede fisk skal indeholde vigtige niveauer (35-50 %) af stærkt fordøjelige proteiner og høj energi gennem fedtstoffer af høj kvalitet for at opretholde deres aktivitet og vækst. De råvarer, der er til rådighed til fremstilling af denne form for akvakultur, har tre hovedoprindelser:
vegetabilske biprodukter af hvede, soja og majs.
II) fiskemel og fiskeolie fra fisk og marine krebsdyr, selv om deres andel af foderet er faldende.
III) I nogle tilfælde også biprodukter fra sektoren for produktion af landdyr, som er meget næringsrige.
I dag fremmes bæredygtige fodringssystemer, der begrænser afhængigheden af fiskemel og fiskeolie fra vilde bestande til fødevareproduktion, f.eks. ved at tilskynde til anvendelse af alternative proteiningredienser såsom alger eller insekter eller affald fra andre industrier. Dette afspejles også i de strategiske retningslinjer for en mere bæredygtig og konkurrencedygtig akvakultur i EU i perioden 2021-2030.