Kalan mikrobiyhteisöjen tutkiminen vesiviljelyalan uusien tautien lieventämiseksi

Vesiviljely on maailman nopeimmin kasvava eläinelintarvikeala, ja sen odotetaan kasvavan edelleen kasvavan väestön ruokkimiseksi. Nykyiset ja (uudelleen) yleistyvät taudit haittaavat kuitenkin kalojen ja simpukoiden viljelyä ja satoa. Monilla taudeilla ei ole käytössä rokotussuunnitelmia, ja antibioottien ja muiden kemikaalien liiallinen käyttö on erittäin huolestuttavaa. Kestävämpi taudintorjuntastrategia kalojen ja äyriäisten suojelemiseksi (uudelleen) puhkeavilta taudeilta voitaisiin saavuttaa ottamalla käyttöön tai lisäämällä suotuisia mikrobeja. ”Terveen” kalamikroman luominen ja ylläpitäminen edellyttää perusteellista ymmärtämystä kalaan liittyvien mikrobiyhteisöjen monimuotoisuudesta ja ajallisesta ja paikkasidonnaisesta dynamiikasta sekä niiden vaikutuksesta niiden vesiisännöjen kasvuun ja terveyteen. Tässä katsauksessa kuvataan näkemyksiä seuraavan sukupolven sekvensoinnin avulla selvitettävien kalabakteeriyhteisöjen monimuotoisuudesta ja toiminnoista ja keskustellaan mikrobien mahdollisuuksista lieventää (uudelleen) vesiviljelyssä esiin nousevia tauteja.