Kalade mikroobikogukondade uurimine uute haiguste leevendamiseks vesiviljeluses

Vesiviljelus on maailma kõige kiiremini kasvav loomatoidusektor ja eeldatavasti kasvab see veelgi, et toita kasvavat elanikkonda. Olemasolevad ja (taas)tekkivad haigused takistavad kalade ja karpide kasvatamist ja saagikust. Paljude haiguste puhul ei ole vaktsineerimisprotokolle kehtestatud ning antibiootikumide ja muude kemikaalide ülemäärane kasutamine on väga murettekitav. Jätkusuutlikuma tauditõrjestrateegia, et kaitsta kalu ja karpe (taas)tekkivate haiguste eest, oleks võimalik saavutada kasulike mikroobide kasutuselevõtu või täiendamisega. Terve kalamikrobioomi loomiseks ja säilitamiseks on vaja põhjalikult mõista kaladega seotud mikroobikoosluste mitmekesisust ja ajalist ruumilist dünaamikat ning nende mõju veeorganismide kasvule ja tervisele. Käesolevas ülevaates kirjeldatakse järgmise põlvkonna sekveneerimise käigus selgunud kalabakterite kogukondade mitmekesisust ja funktsioone ning arutatakse mikroobide potentsiaali leevendada (taas)tekkivaid haigusi vesiviljeluses.