Explorer les communautés microbiennes de poissons pour atténuer les maladies émergentes dans l’aquaculture

L’aquaculture est le secteur de l’alimentation animale qui connaît la croissance la plus rapide au monde et devrait encore augmenter pour nourrir la population humaine croissante. Toutefois, les maladies existantes et (re) émergentes entravent la culture et le rendement des poissons et des coquillages. Pour de nombreuses maladies, les protocoles de vaccination ne sont pas en place et l’utilisation excessive d’antibiotiques et d’autres produits chimiques est très préoccupante. Une stratégie plus durable de lutte contre les maladies afin de protéger les poissons et les coquillages contre les maladies (ré-) émergentes pourrait être réalisée par l’introduction ou l’augmentation de microbes bénéfiques. Afin d’établir et de maintenir un microbiome «sain» des poissons, une compréhension fondamentale de la diversité et de la dynamique temporelle et spatiale des communautés microbiennes associées au poisson et de leur incidence sur la croissance et la santé de leurs hôtes aquatiques est nécessaire. Cet examen décrit les informations relatives à la diversité et aux fonctions des communautés bactériennes de poissons éludées par le séquençage de nouvelle génération et examine le potentiel des microbes pour atténuer les maladies (ré-) émergentes dans l’aquaculture.