Der er meget forskellige produktionsmetoder for EU's akvakulturarter, og nogle af de vigtigste er følgende (STECF's økonomiske datatabel for akvakultur, 2023):
— Indkapslinger, folde, recirkulationssystemer og tanke til laks
Tanke og raceways, recirkulationssystemer og damme til ørred
— Penne, tanke, damme, recirkulationssystemer til havbars og blankesten
— Flåder, polykultur, logline til muslinger
Damme, tanke, raceways, gager, polykultur til karper
— Til bundfiskeri, langline, flåder og polykultur til østers
Damme, raceways, tanke til krebsdyr
— På bund, tanke og raceways, penne, recirkulationssystemer, polykultur, flåder, langline, tankvogne
— Åbne eller lukkede bioreaktorer til mikroalger.
Desuden skal de fleste fiskearter og tang i de tidlige vækstfaser være på et klækkeri og en planteskole. Bløddyrsfrø produceres i rugerier eller indsamles i naturen.