Proizvodi iz akvakulture EU se proizvajajo v skladu z visokimi standardi kakovosti in trajnostnosti, saj obstaja obsežna zakonodaja EU, ki zajema različna vprašanja, ki jih morajo upoštevati proizvajalci v akvakulturi (npr. zakonodaja o zdravju in dobrem počutju živali, varnosti hrane, varnosti krme, veterinarskem zdravljenju, kakovosti vode, zakonodaji o vnosu tujerodnih ali lokalno neprisotnih vrst itd.).