Proizvodi akvakulture u EU-u proizvode se u skladu s visokim standardima kvalitete i održivosti jer postoji velik dio zakonodavstva EU-a kojim su obuhvaćena različita pitanja s kojima se proizvođači u akvakulturi moraju pridržavati (npr. zakonodavstvo o zdravlju životinja, dobrobiti životinja, sigurnosti hrane za životinje, sigurnosti hrane za životinje, veterinarskom liječenju, kvaliteti vode, zakonodavstvu o uvođenju neautohtonih ili lokalno neprisutnih vrsta itd.).