Řízení mikrobiální komunity larev mořských ryb: Celostní perspektiva pro larvikulturu

Dostupnost vysoce kvalitních nedospělých jedinců představuje překážku v chovu mnoha mořských druhů ryb. Škodlivé interakce larev a mikrobů jsou hlavním důvodem nedostatečné životaschopnosti a kvality chovu larev. V rámci tohoto přezkumu zkoumáme mikrobiální komunitu larev ryb z ekologického a ekofyziologického hlediska s cílem vytvořit znalostní základnu pro mikrobiální řízení. Larvy jsou vystaveny obrovskému počtu mikrobů z vnějších a vnitřních zdrojů v intenzivní akvakultuře, jejich relativní význam však závisí na použité technologii chovu (zejména průtokových a recirkulačních systémech) a na retenčním čase vody v nádržích na ryby. Obecně se pozornost zaměřuje na mikroby vstupující do systému, ale mikroby z růstu v rámci systému jsou obvykle podstatnou částí mikrobů, s nimiž se larvy potýkají. Metody nezávislé na kultuře odhalily neočekávanou vysokou bohatost bakteriálních druhů spojených s larevami se 100–250 funkčními taxonomickými jednotkami spojenými s jedním jedincem. Mikrobiota larev se rychle mění až do metamorfózy, nejpravděpodobněji v důsledku změn selekčního tlaku v trávicím traktu, které jsou způsobeny změnami interakcí mezi hostiteli a mikrobiem a mikrobiem. I když se mikrobiota larev výrazně liší od mikrobioty vody a živé potravy, mikrobiota vody silně ovlivňuje mikrobiotu larev. Nacházíme se v rané fázi porozumění interakcím larev a mikrobů in vivo, ale některé studie s jinými zvířaty než rybami zdůrazňují, že jsme dosud podceňovali složitost těchto interakcí. Předkládáme příklady prokazující rozmanitost těchto interakcí. Existuje celá řada metod mikrobiálního řízení, které se zaměřují na neselektivní redukci mikrobů, selektivní zlepšení mikrobů a na zlepšení odolnosti larev vůči mikrobům. Bylo však podrobně zkoumáno poměrně málo metod. Domníváme se, že větší rozmanitost přístupů k nakládání s mikrobiálními látkami má velký prospěch. Vzhledem k tomu, že mnoho metod mikrobiálního řízení představuje narušení mikrobiální komunity, tvrdíme, že je zapotřebí ekologická teorie, aby bylo možné předvídat a testovat dlouhodobější důsledky v interakcích mikrobů a mikrobů a larev. Nakonec předkládáme několik doporučení pro budoucí výzkum a vývoj.