Forvaltning af det mikrobielle samfund af marine fiskelarver: Et holistisk perspektiv for larvekultur

Tilgængeligheden af ungfisk af høj kvalitet er en flaskehals i forbindelse med opdræt af mange havfiskearter. Skadelige vekselvirkninger mellem larver og mikrobe er en af hovedårsagerne til dårlig levedygtighed og kvalitet i larveopdræt. I denne gennemgang undersøger vi det mikrobielle samfund af fiskelarver ud fra et økologisk og økofysiologisk perspektiv med henblik på at udvikle videngrundlaget for mikrobiel forvaltning. Larverne udsættes for et stort antal mikrober fra eksterne og interne kilder i intensiv akvakultur, men deres relative betydning afhænger af den anvendte opdrætsteknologi (navnlig gennemstrømningssystemer i forhold til recirkulationssystemer) og vandbindingstiden i fiskebeholderne. Generelt har der været fokus på mikrober, der kommer ind i systemet, men mikrober fra vækst i systemet er normalt en væsentlig del af de mikrober, som larverne støder på. Dyrkningsuafhængige metoder har afsløret en uventet høj rigdom af bakteriearter, der er forbundet med larver, med 100-250 operationelle taksonomiske enheder, der er forbundet med én person. Larvernes mikrobiota ændrer sig hurtigt indtil metamorfosen, sandsynligvis på grund af ændringer i udvælgelsestrykket i fordøjelseskanalen som følge af ændringer i værtsmikrobe og mikrobe-mikrobe-vekselvirkninger. Selv om larvernes mikrobiota adskiller sig markant fra mikrobiota i vandet og den levende føde, påvirker vandets mikrobiota kraftigt larvernes mikrobiota. Vi befinder os i den tidlige fase af forståelsen af larvemikrobe-interaktioner in vivo, men nogle undersøgelser med andre dyr end fisk understreger, at vi hidtil har undervurderet kompleksiteten af disse interaktioner. Vi fremlægger eksempler, der viser mangfoldigheden af disse interaktioner. Der findes en lang række mikrobielle håndteringsmetoder, der fokuserer på ikke-selektiv reduktion af mikrober, selektiv forbedring af mikrober og forbedring af larvernes modstandsdygtighed over for mikrober. Relativt få metoder er imidlertid blevet grundigt undersøgt. Vi mener, at der er meget at vinde ved at øge mangfoldigheden af tilgange til mikrobiel forvaltning. Da mange mikrobielle håndteringsmetoder er forstyrrelser i det mikrobielle samfund, hævder vi, at der er behov for økologisk teori for at forudse og teste for langsigtede konsekvenser i samspillet mellem mikrobe og mikrobilarver. Endelig fremsætter vi nogle anbefalinger til fremtidig forskning og udvikling.