Gestione della comunità microbica delle larve di pesci marini: Una prospettiva olistica per la larvicoltura

La disponibilità di novellame di alta qualità costituisce una strozzatura nell'allevamento di molte specie ittiche marine. Le interazioni tra le larve e i microbi dannosi sono uno dei principali motivi della scarsa vitalità e della scarsa qualità nell'allevamento delle larve. In questa analisi esploriamo la comunità microbica delle larve di pesci da un punto di vista ecologico ed ecofisiologico, con l'obiettivo di sviluppare la base di conoscenze per la gestione microbica. Le larve sono esposte a un gran numero di microbi provenienti da fonti esterne e interne nell'acquacoltura intensiva, ma la loro importanza relativa dipende dalla tecnologia di allevamento utilizzata (in particolare dai sistemi a flusso continuo o a ricircolo) e dal tempo di ritenzione dell'acqua nelle vasche. In generale, l'attenzione è stata rivolta ai microbi che entrano nel sistema, ma i microbi provenienti dalla crescita all'interno del sistema rappresentano di norma una parte sostanziale dei microbi riscontrati dalle larve. I metodi indipendenti dalla coltura hanno rivelato un'inattesa elevata ricchezza di specie batteriche associate alle larve, con 100-250 unità tassonomiche operative associate a un individuo. Il microbiota delle larve cambia rapidamente fino alla metamorfosi, molto probabilmente a causa di cambiamenti nella pressione di selezione nel tubo digerente dovuti a cambiamenti nelle interazioni tra microbe e microbici. Sebbene il microbiota delle larve sia nettamente diverso dal microbiota dell'acqua e dal cibo vivo, il microbiota dell'acqua incide fortemente sul microbiota delle larve. Siamo nella fase iniziale di comprensione delle interazioni larvae-microbe in vivo, ma alcuni studi con animali diversi dai pesci sottolineano che finora abbiamo sottovalutato la complessità di tali interazioni. La Corte presenta esempi che dimostrano la diversità di tali interazioni. Esiste un'ampia varietà di metodi di gestione microbica, incentrati sulla riduzione non selettiva dei microbi, sul miglioramento selettivo dei microbi e sul miglioramento della resistenza delle larve ai microbi. Tuttavia, relativamente pochi metodi sono stati studiati in modo approfondito. Riteniamo che vi sia molto da guadagnare aumentando la diversità degli approcci alla gestione microbica. Poiché molti metodi di gestione microbica sono perturbazioni della comunità microbica, riteniamo che sia necessaria una teoria ecologica per prevedere e testare le conseguenze a più lungo termine nelle interazioni tra microbe e larve microbiche. Infine, la Corte formula alcune raccomandazioni per la ricerca e lo sviluppo futuri.