Merekalade vastsete mikroobse koosluse haldamine: Terviklik perspektiiv vastsetele

Kvaliteetsete noorkalade kättesaadavus on paljude merekalaliikide kasvatamise kitsaskoht. Kahjulikud vastsete ja mikroobi vastastikmõjud on peamine põhjus, miks vastsete kasvatamise elujõulisus ja kvaliteet on halb. Käesolevas ülevaates uurime kalavastsete mikroobset kogukonda ökoloogilisest ja ökofüsioloogilisest vaatepunktist, et arendada mikroobide majandamise teadmusbaasi. Vastsed puutuvad kokku suure hulga mikroobidega, mis pärinevad intensiivse vesiviljeluse välis- ja siseallikatest, kuid nende suhteline tähtsus sõltub kasutatavast kasvatustehnoloogiast (eelkõige läbivoolu- või ringlussüsteemid) ja vee retentsiooniajast kalamahutites. Üldiselt on keskendutud süsteemi sisenevatele mikroobidele, kuid süsteemis kasvavad mikroobid moodustavad tavaliselt olulise osa vastsetega kokku puutuvatest mikroobidest. Kultuurist sõltumatud meetodid on paljastanud vastsetega seostatavate bakteriliikide ootamatu suure rikkuse, kusjuures ühe isendiga seostatakse 100–250 toimivat taksonoomilist üksust. Vastsete mikrobiota muutub kiiresti kuni metamorfoosini, kõige tõenäolisemalt seedetrakti valikurõhu muutuste tõttu, mis on tingitud peremees-mikroobi ning mikroobi ja mikroobi vastastikmõju muutustest. Kuigi vastsete mikrobiota erineb selgelt vee ja elustoidu mikrobioodist, mõjutab vee mikrobiota tugevalt vastsete mikrobiootat. Me oleme in vivo vastsete ja mikroobide vastastikuse mõju mõistmise varases etapis, kuid mõnes uuringus muude loomadega kui kaladega rõhutatakse, et oleme seni alahinnanud nende vastastikmõjude keerukust. Esitame näiteid, mis näitavad nende vastastikmõjude mitmekesisust. Olemas on palju erinevaid mikroobide haldamise meetodeid, mis keskenduvad mikroobide mitteselektiivsele vähendamisele, mikroobide valikulisele täiustamisele ja vastsete mikroobide suhtes resistentsuse parandamisele. Siiski on põhjalikult uuritud suhteliselt vähe meetodeid. Usume, et mikroobide haldamise lähenemisviiside mitmekesisuse suurendamisega on palju võita. Kuna paljud mikroobide haldamise meetodid on mikroobide kogukonna häiringud, on meie arvates vaja ökoloogilist teooriat, et näha ette ja katsetada pikemaajalisi tagajärgi mikroobide ja mikroobide ning mikroobide ja vastsete vastastikusele mõjule. Lõpuks esitame mõned soovitused tulevaseks teadus- ja arendustegevuseks.