Upravljanje mikrobne skupnosti ličink morskih rib: Celostni pogled na larvikulturo

Razpoložljivost visokokakovostnih nedoraslih organizmov je ozko grlo pri gojenju številnih vrst morskih rib. Škodljivi medsebojni vplivi ličink in mikrobov so glavni razlog za slabo sposobnost preživetja in slabo kakovost reje ličink. V tem pregledu raziskujemo mikrobno skupnost ličink rib z ekološkega in ekološko fiziološkega vidika, da bi razvili bazo znanja za upravljanje mikrobov. Ličinke so izpostavljene velikemu številu mikrobov iz zunanjih in notranjih virov v intenzivni akvakulturi, vendar je njihov relativni pomen odvisen od uporabljene tehnologije gojenja (zlasti pretočnih in recirkulacijskih sistemov) in zadrževalnega časa vode v bazenih za ribe. Na splošno je bil poudarek na mikrobih, ki vstopajo v sistem, vendar so mikrobi iz rasti znotraj sistema običajno znaten del mikrobov, s katerimi se srečujejo ličinke. Metode, neodvisne od kulture, so pokazale nepričakovano visoko bogastvo bakterijskih vrst, povezanih s ličinkami, pri čemer je 100–250 operativnih taksonomskih enot povezanih z enim posameznikom. Mikrobiota ličink se hitro spreminja do metamorfoze, najverjetneje zaradi sprememb v selektivnem tlaku v prebavnem traktu, ki so posledica sprememb interakcije med gostiteljem in mikromikrobi ter mikrobi in mikrobi. Čeprav se mikrobiota ličink bistveno razlikuje od mikrobiote vode in žive hrane, mikrobiota vode močno vpliva na mikrobioto ličink. V zgodnji fazi razumevanja interakcije med ličinkami in mikrobi in vivo, nekatere študije z drugimi živalmi, ki niso ribe, pa poudarjajo, da smo doslej podcenjevali kompleksnost teh interakcij. Predstavljamo primere, ki dokazujejo raznolikost teh interakcij. Obstajajo številne metode upravljanja mikrobov, ki se osredotočajo na neselektivno redukcijo mikrobov, selektivno izboljšanje mikrobov in izboljšanje odpornosti ličink proti mikrobi. Vendar je bilo obširno proučenih razmeroma malo metod. Menimo, da je mogoče veliko pridobiti s povečanjem raznolikosti pristopov k upravljanju mikrobov. Ker so številne metode upravljanja mikrobov motnje mikrobne skupnosti, trdimo, da je ekološka teorija potrebna za predvidevanje in preskušanje dolgoročnih posledic interakcij mikrobov in mikromikrobov ter mikrobov in ličink. Na koncu podajamo nekaj priporočil za prihodnje raziskave in razvoj.