Upravljanje mikrobnom zajednicom ličinki morskih riba: Holistička perspektiva za larvikulturu

Dostupnost visokokvalitetnih juvenilnih jedinki usko je grlo u uzgoju mnogih morskih ribljih vrsta. Štetne interakcije ličinki i mikrobe glavni su razlog loše održivosti i kvalitete uzgoja ličinki. U ovom pregledu istražujemo mikrobnu zajednicu ličinki riba iz ekološke i eko-fiziološke perspektive u cilju razvoja baze znanja za mikrobno upravljanje. Ličinke su izložene velikom broju mikroba iz vanjskih i unutarnjih izvora u intenzivnoj akvakulturi, ali njihova relativna važnost ovisi o korištenoj tehnologiji uzgoja (posebno protočnim i recirkulacijskim sustavima) i vremenu zadržavanja vode u bazenima za ribe. Općenito, naglasak je bio na mikrobama koje ulaze u sustav, ali mikrobe iz rasta unutar sustava obično čine znatan dio mikroba s kojima se suočavaju ličinke. Metode neovisne o kulturi otkrile su neočekivano veliko bogatstvo bakterijskih vrsta povezano s ličinkama, sa 100 – 250 operativnih taksonomskih jedinica povezanih s jednom jedinkom. Mikrobiota ličinki brzo se mijenja do metamorfoze, najvjerojatnije zbog promjena u selekcijskom tlaku u probavnom traktu uzrokovanih promjenama u interakciji s mikroorganizmima domaćinima i mikrobama. Iako se mikrobiota ličinki razlikuje od mikrobiote vode i žive hrane, mikrobiota vode snažno utječe na mikrobiotu ličinki. U ranoj smo fazi razumijevanja interakcija ličinki i mikrobe in vivo, ali neke studije koje uključuju druge životinje osim riba naglašavaju da smo dosad podcijenili složenost tih interakcija. Sud iznosi primjere koji pokazuju raznolikost tih interakcija. Postoje brojne metode mikrobnog upravljanja usmjerene na neselektivno smanjenje mikroba, selektivno poboljšanje mikroba i poboljšanje otpornosti ličinki na mikrobe. Međutim, relativno mali broj metoda temeljito je ispitan. Smatramo da je mnogo toga potrebno ostvariti povećanjem raznolikosti pristupa mikrobnom upravljanju. Budući da mnoge mikrobne metode upravljanja narušavaju mikrobnu zajednicu, tvrdimo da je ekološka teorija potrebna kako bi se predvidjele i ispitale dugoročne posljedice u interakcijama mikrobe i mikroba. Naposljetku, Sud iznosi određene preporuke za buduća istraživanja i razvoj.