Gestão da comunidade microbiana de larvas de peixes marinhos: Uma perspetiva holística para a larvicultura

A disponibilidade de juvenis de elevada qualidade constitui um estrangulamento na criação de muitas espécies de peixes marinhos. As interações prejudiciais entre as larvas são uma das principais razões para a fraca viabilidade e qualidade da criação de larvas. Nesta análise, exploramos a comunidade microbiana de larvas de peixes de uma perspetiva ecológica e ecofisiológica, com o objetivo de desenvolver a base de conhecimentos para a gestão microbiana. As larvas estão expostas a um grande número de micróbios provenientes de fontes externas e internas na aquicultura intensiva, mas a sua importância relativa depende da tecnologia de criação utilizada (especialmente os sistemas de fluxo contínuo versus sistemas de recirculação) e do tempo de retenção da água nos tanques de peixes. De um modo geral, a tónica tem sido colocada nos micróbios que entram no sistema, mas os micróbios do crescimento no sistema são normalmente uma parte substancial dos micróbios encontrados pelas larvas. Os métodos independentes da cultura revelaram uma elevada riqueza inesperada de espécies bacterianas associadas às larvas, com 100-250 unidades taxonómicas operacionais associadas a um indivíduo. A microbiota das larvas muda rapidamente até à metamorfose, muito provavelmente devido a alterações na pressão de seleção no aparelho digestivo causadas por alterações na microgeração de hospedeiro e nas interações microbe-microbe. Embora a microbiota das larvas seja nitidamente diferente da microbiota da água e dos alimentos vivos, a microbiota da água afeta fortemente a microbiota das larvas. Estamos na fase inicial de compreensão das interações larvas in vivo, mas alguns estudos com outros animais para além dos peixes salientam que, até à data, subestimámos a complexidade destas interações. Apresentamos exemplos que demonstram a diversidade destas interações. Existe uma grande variedade de métodos de gestão microbiana, centrando-se na redução não seletiva dos micróbios, no reforço seletivo dos micróbios e na melhoria da resistência das larvas contra os micróbios. No entanto, relativamente poucos métodos foram amplamente estudados. Acreditamos que há muito a ganhar aumentando a diversidade de abordagens para a gestão microbiana. Uma vez que muitos métodos de gestão microbiana são perturbações da comunidade microbiana, defendemos que a teoria ecológica é necessária para prever e testar consequências a mais longo prazo nas interações microbelo-micrófico-microsservas e microbe-larvas. Por último, o Tribunal formula algumas recomendações para a investigação e o desenvolvimento futuros.