Διαχείριση της μικροβιακής κοινότητας των προνυμφών θαλάσσιων ψαριών: Μια ολιστική προοπτική για την καλλιέργεια προνυμφών

Η διαθεσιμότητα ιχθυδίων υψηλής ποιότητας αποτελεί εμπόδιο στην εκτροφή πολλών θαλάσσιων ειδών ιχθύων. Οι επιζήμιες αλληλεπιδράσεις προνυμφών και μικροοργανισμών αποτελούν βασικό λόγο για την κακή βιωσιμότητα και ποιότητα στην εκτροφή προνυμφών. Στο πλαίσιο της παρούσας επισκόπησης, διερευνούμε τη μικροβιακή κοινότητα προνυμφών ψαριών από οικολογική και οικολογική άποψη, με στόχο την ανάπτυξη της γνωστικής βάσης για τη μικροβιακή διαχείριση. Οι προνύμφες εκτίθενται σε τεράστιο αριθμό μικροβίων από εξωτερικές και εσωτερικές πηγές εντατικής υδατοκαλλιέργειας, αλλά η σχετική σημασία τους εξαρτάται από τη χρησιμοποιούμενη τεχνολογία εκτροφής (ιδίως συστήματα συνεχούς ροής έναντι συστημάτων ανακυκλοφορίας) και τον χρόνο κατακράτησης του νερού στις δεξαμενές ιχθύων. Γενικά, δόθηκε έμφαση στα μικρόβια που εισέρχονται στο σύστημα, αλλά τα μικρόβια από την ανάπτυξη εντός του συστήματος αποτελούν συνήθως σημαντικό μέρος των μικροβίων που συναντούν οι προνύμφες. Μέθοδοι ανεξάρτητες από την καλλιέργεια αποκάλυψαν απροσδόκητο υψηλό πλούτο ειδών βακτηρίων που συνδέονται με τις προνύμφες, με 100-250 επιχειρησιακές ταξινομικές μονάδες που συνδέονται με ένα άτομο. Η μικροχλωρίδα των προνυμφών μεταβάλλεται ταχέως έως τη μεταμόρφωση, πιθανότατα λόγω μεταβολών στην πίεση επιλογής του πεπτικού συστήματος που προκαλούνται από αλλαγές στις αλληλεπιδράσεις μεταξύ μικροβίων και μικροοργανισμών υποδοχής. Παρόλο που η μικροχλωρίδα των προνυμφών διαφέρει σαφώς από τη μικροχλωρίδα του νερού και τη ζωντανή τροφή, η μικροχλωρίδα του νερού επηρεάζει έντονα τη μικροχλωρίδα των προνυμφών. Βρισκόμαστε σε πρώιμο στάδιο κατανόησης των αλληλεπιδράσεων προνυμφών και μικρομέτρων in vivo, αλλά ορισμένες μελέτες με άλλα ζώα εκτός από τα ψάρια τονίζουν ότι μέχρι στιγμής έχουμε υποτιμήσει την πολυπλοκότητα αυτών των αλληλεπιδράσεων. Παρουσιάζουμε παραδείγματα που καταδεικνύουν την ποικιλομορφία αυτών των αλληλεπιδράσεων. Υπάρχει μεγάλη ποικιλία μικροβιακών μεθόδων διαχείρισης, οι οποίες επικεντρώνονται στη μη επιλεκτική αναγωγή των μικροβίων, στην επιλεκτική βελτίωση των μικροβίων και στη βελτίωση της αντοχής των προνυμφών έναντι των μικροβίων. Ωστόσο, σχετικά λίγες μέθοδοι έχουν μελετηθεί εκτενώς. Πιστεύουμε ότι είναι πολλά να κερδίσουμε από την αύξηση της ποικιλομορφίας των προσεγγίσεων για τη μικροβιακή διαχείριση. Δεδομένου ότι πολλές μέθοδοι μικροβιακής διαχείρισης αποτελούν διαταραχές της μικροβιακής κοινότητας, υποστηρίζουμε ότι η οικολογική θεωρία είναι απαραίτητη για την πρόβλεψη και τη δοκιμή μακροπρόθεσμων συνεπειών στις αλληλεπιδράσεις μικρομικροβίων και μικροπρονυμφών. Τέλος, διατυπώνουμε ορισμένες συστάσεις για τη μελλοντική έρευνα και ανάπτυξη.