Zkoumání genetické rozmanitosti a geonomických podpisů vývoje pomocí hatchery indukovaného v populaci Gilthead Seabream (Sparus aurata)

Určení genetického základu domestikace u druhů ryb má pro odvětví akvakultury včasný význam pro zvýšení produktivity, kvality a dobrých životních podmínek chovaných ryb. Cílem této studie je prozkoumat do značné míry neznámý vývoj růžichy giltheadové, která je jednou z nejdůležitějších chovaných ryb v oblasti Středozemního moře, akvakulturou. Použili jsme panel 1159 strategických strategických plánů genomu a genotypizovali 956 ryb z 23 volně žijících populací ve Středozemním moři a 362 ryb ve farmovém chovu z pěti řeckých líhní. Posuzovali jsme genetickou rozmanitost populací ve vzorku a kontrastovali výsledky čtyř různých přístupů metod detekce odlehlých hodnot. Uznali jsme jednoho velmi silného kandidáta a dva dobré kandidáty na SNP s důkazy o vývoji růžichy mořčáka evropského vyvolaného akvakulturou. Vysvětlivka těchto SNP odhalila sousední geny s biologickými rolemi od tolerance stresu a odolnosti vůči pohlavnímu zrání, které mohou vysvětlit naše připomínky. Závěrem ukazujeme, že genom růžichy giltheadové navzdory tomu, že se často navrhuje, aby se tento druh nacházel v raných fázích domestikačního procesu, prokazuje vývoj způsobený akvakulturou. Podáváme zprávu o seznamu genů, které mohou vysvětlit naše připomínky a které mohou být dále zkoumány. Předpokládáme, že naše zjištění podnítí další výzkum s využitím panelů SNP o vyšší hustotě, které mohou objasnit genomickou architekturu domestikace u tohoto druhu s vysokým akvakulturním zájmem.