Undersøgelse af genetisk mangfoldighed og genomiske signaturer af Hatchery-induced Evolution i Gilthead Seabream (Sparus aurata) Populationer

Identifikationen af det genetiske grundlag for udsætning af fiskearter er af rettidig betydning for akvakultursektoren med henblik på at øge produktiviteten, kvaliteten og velfærden for opdrættede fisk. Formålet med undersøgelsen er at undersøge den stort set ukendte udvikling i guldblankesten, som er en af de vigtigste opdrættede fisk i Middelhavsområdet. Vi anvendte et panel bestående af 1159 genomdækkende SNP'er og genotypebestemte 956 fisk fra 23 vilde bestande af hele Middelhavet og 362 opdrættede fisk fra fem græske klækkerier. Vi vurderede den genetiske mangfoldighed i de populationer, der indgik i stikprøven, og sammenlignede resultaterne af fire forskellige metoder til påvisning af afvigende værdier. Vi anerkendte en meget stærk kandidat og to gode kandidatlandes SNP'er med dokumentation for akvakulturens udvikling i guldblankesten. Anmærkningen af disse SNP afslørede nabogener med biologiske roller fra stresstolerance og sygdomsresistens til seksuel modning, som kan forklare vores observationer. Vi konkluderer, at genet af guldblankesten viser tegn på en udvikling som følge af akvakulturen, selv om det ofte foreslås, at arten befinder sig i de tidlige faser af husdyravlsprocessen. Vi rapporterer om en liste over gener, der kan forklare vores bemærkninger, og som kan undersøges nærmere. Vi forventer, at vores resultater vil stimulere yderligere forskning med anvendelse af SNP-paneler med højere tæthed, der kan belyse den genomiske struktur af husdyravl hos denne art af stor interesse for akvakulturen.