Hautomointensiivisen kehityksen (Sparus aurata) geneettisen monimuotoisuuden ja geneettisten allekirjoitusten tutkiminen

Kalalajien kotieläinjalostuksen geneettisen perustan tunnistaminen on vesiviljelyalalle oikea-aikaista, jotta voidaan parantaa viljeltyjen kalojen tuottavuutta, laatua ja hyvinvointia. Tämän tutkimuksen tavoitteena on tutkia laajasti tuntematonta vesiviljelystä johtuvaa kehitystä kultaotsa-ahvenessa, joka on yksi Välimeren alueen tärkeimmistä viljellyistä kaloista. Tilintarkastustuomioistuin käytti paneelia, jossa oli 1159 genominlaajuista SNP:tä ja jonka genotyyppi oli 956 kalaa 23:sta Välimeren levinneisyysalueen luonnonvaraisesta populaatiosta ja 362 viljellystä kalasta viidestä kreikkalaisesta hautomosta. Tilintarkastustuomioistuin arvioi otokseen valittujen populaatioiden geneettistä monimuotoisuutta ja vertasi neljän erilaisen poikkeavan havaitsemismenetelmän tuloksia. Tilintarkastustuomioistuin antoi tunnustusta yhdelle erittäin vahvalle ehdokasmaalle ja kahdelle hyvälle ehdokasmaalle, joilla oli näyttöä vesiviljelystä johtuvasta pilkkupagellin kehityksestä. Näiden spesifikaatioiden havainnot paljastivat vierekkäisiä geenejä, joilla on stressinsietokyvyn ja tautien vastustuskyvyn sukupuolikypsyttämiselle biologiset roolit ja jotka voivat selittää havaintojamme. Yhteenvetona voidaan todeta, että kultaotsa-ahvenen genomi osoittaa, että vaikka lajin ehdotetaan usein olevan kasvatusprosessin alkuvaiheessa, vesiviljelystä johtuvasta kehityksestä on näyttöä. Tilintarkastustuomioistuin raportoi geeniluettelosta, joka voi selittää havaintojamme ja jota voidaan tutkia tarkemmin. Ennakoimme, että löydöksemme edistävät lisätutkimusta, kun käytetään tiheämpiä SNP-paneeleja, joiden avulla voidaan selkeyttää tämän vesiviljelyn kannalta erittäin tärkeän lajin kesytyksen genomiarkkitehtuuria.