Undersökning av genetisk mångfald och genetiska signaturer av Hatchery-Inducerad Evolution i befolkningen i Gilthead Seabream (Sparus aurata)

Identifieringen av den genetiska grunden för domesticering av fiskarter är av läglig betydelse för vattenbruksnäringen för att öka den odlade fiskens produktivitet, kvalitet och välbefinnande. Syftet med denna studie är att undersöka den i stort sett okända akvaktultureinducerade utvecklingen av gilthead fläckpagell, som är en av de viktigaste odlade fiskarna i Medelhavsområdet. Vi använde en panel med 1159 genombreda SNP och genotypade 956 fiskar från 23 vilda populationer i Medelhavsområdet och 362 odlad fisk från fem grekiska kläckerier. Vi bedömde den genetiska mångfalden hos de utvalda populationerna och jämförde resultaten från fyra olika metoder för detektion av avvikande värden. Vi erkände en mycket stark kandidat och två goda kandidater till SNP med belägg för akvaktultureinducerad utveckling av gilthead fläckpagell. Kommentaren till dessa SNP avslöjade angränsande gener med biologiska roller från stresstolerans och sjukdomsmotstånd mot sexuell mognad, vilket kan förklara våra observationer. Sammanfattningsvis visar vi att genomet av guldfläckpagell, trots att arten ofta föreslås befinna sig i ett tidigt skede av domesticeringsprocessen, visar tecken på utveckling som induceras av akvatiska arter. Vi rapporterar om en förteckning över gener som kan förklara våra iakttagelser och som kan komma att utredas ytterligare. Vi räknar med att våra resultat kommer att stimulera ytterligare forskning med användning av SNP-paneler med högre densitet som kan belysa den genomiska arkitekturen för domesticering hos denna art av stort vattenbruksintresse.