Studiare la diversità genetica e le firme genomiche dell'evoluzione ridotta della popolazione di Gilthead Seabream (Sparus aurata)

L'individuazione della base genetica della progenie domestica nelle specie ittiche riveste un'importanza tempestiva per il settore dell'acquacoltura al fine di aumentare la produttività, la qualità e il benessere dei pesci d'allevamento. L'obiettivo di questo studio è esaminare l'evoluzione, ampiamente sconosciuta, indotta dall'acquacoltura nell'occhialone, che è uno dei più importanti pesci di allevamento della regione mediterranea. Abbiamo utilizzato un panel di 1159 SNP a livello genomico e abbiamo genotipato 956 pesci provenienti da 23 popolazioni selvatiche di distribuzione a livello mediterraneo e 362 pesci di allevamento provenienti da cinque incubatoi greci. La Corte ha valutato la diversità genetica delle popolazioni incluse nel campione e ha messo a confronto i risultati di quattro diversi approcci dei metodi di rilevazione dei valori anomali. Abbiamo riconosciuto un candidato molto forte e due SNP altamente candidati con prove dell'evoluzione indotta dall'acquacoltura nell'occhialone. L'annotazione di questi PSN ha rivelato geni vicini con ruoli biologici, dalla tolleranza allo stress e dalla resistenza alle malattie alla maturazione sessuale, che possono spiegare le nostre osservazioni. In conclusione, dimostriamo che il genoma dell'occhialone, nonostante si suggerisca spesso che la specie si trovi nelle prime fasi del processo di addomesticazione, dimostra un'evoluzione indotta dall'acquacoltura. La Corte riferisce su un elenco di geni che possono spiegare le proprie osservazioni e che possono essere oggetto di ulteriori indagini. Prevediamo che le nostre conclusioni stimoleranno ulteriori ricerche con l'uso di pannelli SNP a densità più elevata che possano chiarire l'architettura genomica dell'addomesticazione in questa specie di grande interesse acquatico.