Investigarea diversității genetice și a semnăturilor genomice ale evoluției horticole din Gilthead Seabagel (Sparus aurata)

Identificarea bazei genetice de domesticare a speciilor de pești este de o importanță oportună pentru industria acvaculturii, în vederea creșterii productivității, a calității și a bunăstării peștilor de crescătorie. Obiectivul acestui studiu este de a investiga evoluția, în mare parte necunoscută, indusă de acvacultură, a pagelului argintiu, care este unul dintre cei mai importanți pești de crescătorie din regiunea mediteraneeană. Curtea a utilizat un grup format din 1159 de PSN-uri la nivelul întregului genom și a inclus 956 de pești din 23 de populații sălbatice cu distribuție la nivel mediteraneean și 362 de pești de crescătorie din cinci incubatoare grecești. Curtea a evaluat diversitatea genetică a populațiilor incluse în eșantion și a contrastat rezultatele a patru abordări diferite ale metodelor de detectare a valorilor aberante. Am recunoscut un candidat foarte puternic și două persoane candidate bune, cu dovezi privind evoluția indusă de acvacultură în ceea ce privește pagelul argintiu. Adnotarea acestor PSN-uri a scos la iveală genele învecinate cu roluri biologice, de la toleranța la stres și rezistența la boli la maturarea sexuală, care pot explica observațiile noastre. În concluzie, demonstrăm că genomul pagelului argintiu, în pofida faptului că se sugerează adesea că specia se află în primele etape ale procesului de domesticare, prezintă dovezi ale unei evoluții induse de acvacultură. Curtea raportează cu privire la o listă de gene care pot explica observațiile sale și care pot fi investigate în continuare. Anticipăm că constatările noastre vor stimula cercetarea suplimentară prin utilizarea panourilor SNP cu densitate mai mare, care pot elucida arhitectura genomică a domesticării în cazul acestei specii de mare interes acvacultural.