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EU Aquaculture Assistance Mechanism

Untersuchung der genetischen Vielfalt und der genomischen Signaturen der von der Hatcherinduzierten Entwicklung in der Gilthead-Seebrasse-Bevölkerung (Sparus aurata)

Description

Die Ermittlung der genetischen Grundlage für die Besiedlung von Fischarten ist für die Aquakulturindustrie von aktueller Bedeutung, um die Produktivität, die Qualität und das Wohlergehen von Zuchtfischen zu steigern. Ziel dieser Studie ist es, die weitgehend unbekannte aquakulturbedingte Entwicklung der Rotbrasse zu untersuchen, die einer der wichtigsten Zuchtfische im Mittelmeerraum ist. Wir nutzten ein Panel von 1159 genomweiten SNP und genotypisierten 956 Fische aus 23 wild lebenden Populationen mediterraner Verbreitung und 362 Zuchtfische aus fünf griechischen Brütereien. Der Hof bewertete die genetische Vielfalt der beprobten Populationen und stellte die Ergebnisse von vier verschiedenen Ansätzen für Ausreißernachweismethoden gegenüber. Wir erkannten einen sehr starken Kandidaten und zwei gute SNP-Kandidaten mit Belegen für die Aquakultur-induzierte Entwicklung der Jungbrassen an. Die Anmerkung zu diesen SNP ergab benachbarte Gene mit biologischen Rollen von Stresstoleranz und Krankheitsresistenz gegenüber sexueller Reife, was unsere Beobachtungen erklären könnte. Abschließend zeigen wir, dass das Genom der Robbenbrasse trotz der Tatsache, dass häufig davon ausgegangen wird, dass sich die Art in den frühen Phasen des Einheimischenprozesses befindet, Belege für eine von der Aquakultur ausgehende Entwicklung zeigt. Wir berichten über eine Liste von Genen, die unsere Bemerkungen erläutern und weiter untersucht werden können. Wir gehen davon aus, dass unsere Ergebnisse zusätzliche Forschung durch den Einsatz von SNP-Panels mit höherer Dichte anstoßen werden, die die genomische Architektur der Hausinstallation bei dieser Art von hohem aquakulturellem Interesse verdeutlichen können.

Details

Original Author(s)
Gkagkvouzis, Konstantinos
Papakostas, Spiros
Maroso, Francesco
Karaiskou, Nikoleta
Carr, Adrian
Eg Nielsen, Einar
Bargelloni, Luca
Triantafyllidis, Alexandros
Topic(s)
Diversifizierung und Wertzuwachs, Daten und Überwachung, Wissen und Innovation, Tierwohl
Geographical Coverage
European
Date
November 05, 2021
Source