Ģenētiskās daudzveidības un genomisko pazīmju izpēte attiecībā uz inkubatoru izraisītu evolūciju Gilthead jūrasbremā (Sparus aurata) populācijās

Lai palielinātu audzēto zivju produktivitāti, kvalitāti un labturību, akvakultūras nozarei savlaicīgi ir svarīgi noteikt pieradināšanas ģenētisko bāzi zivju sugām. Šā pētījuma mērķis ir izpētīt lielā mērā nezināmu akvakultūras izraisītu jūrasputnu attīstību, kas ir viena no svarīgākajām audzētajām zivīm Vidusjūras reģionā. Mēs izmantojām paneli ar 1159 genoma mēroga SNP un genotipa 956 zivīm no 23 Vidusjūras izplatības savvaļas populācijām un 362 saimniecībās audzētām zivīm no piecām Grieķijas inkubatoriem. Mēs vērtējām izlasē iekļauto populāciju ģenētisko daudzveidību un salīdzinājām četru dažādu izlecošo noteikšanas metožu pieeju rezultātus. Mēs atzinām vienu ļoti spēcīgu kandidātu un divus labus SNP kandidātus ar pierādījumiem par akvakultūru izraisītu jūrasputnu attīstību. Šo SNP anotācijā atklājās blakusesoši gēni, kuriem ir bioloģiskas lomas, sākot ar izturību pret stresu un slimību izturību pret dzimumbriedumu, kas var izskaidrot mūsu novērojumus. Visbeidzot, mēs pierādījām, ka, neraugoties uz to, ka bieži tiek ierosināts, ka suga atrodas agrīnos pieradināšanas procesa posmos, zeltainās jūrasputnu genoms liecina par akvakultūras izraisītu evolūciju. Mēs ziņojam par gēnu sarakstu, kas var izskaidrot mūsu novērojumus un ko var izmeklēt sīkāk. Mēs paredzam, ka mūsu konstatējumi stimulēs papildu pētījumus, izmantojot lielāka blīvuma SNP paneļus, kas var izskaidrot šīs akvakultūrai nozīmīgas sugas domesticācijas genomisko arhitektūru.