— Преди стопанствата за аквакултури да могат да функционират, бъдещите производители на аквакултури трябва да получат разрешение от компетентните национални органи (понякога регионалните органи могат да отговарят за разрешенията). В своята оценка органите проверяват дали предложеното място е подходящо и внимателно проучват потенциалното въздействие на стопанството върху околната среда.
Производителите на аквакултури се нуждаят от разрешение, преди да използват морска или прясна вода за стопанството. Когато върнат водата в околната среда, състоянието на водното тяло не трябва да се влошава.
— Освен това животновъдните обекти за аквакултура трябва да бъдат регистрирани или одобрени от санитарните органи, занимаващи се със здравето на животните, като както земеделският стопанин, така и тези органи са задължени да извършват надзор за евентуални болести.
— След като бъдат получени всички разрешения, производителите на аквакултури трябва да отговарят на няколко условия, за да се гарантира, че дейностите, свързани с аквакултурите, зачитат околната среда, здравето на хората и животните и хуманното отношение към животните.
— Получилите разрешение стопанства трябва да продължат да наблюдават въздействието си върху околната среда.
— С цел опазване на околната среда производителите могат да използват само разрешени фуражи, почистващи продукти и лекарства.
— По отношение на здравето на животните земеделските стопани са задължени също така да водят няколко регистъра, включително за броя на животните, които влизат и напускат стопанството, и за броя на умрели животни. Освен това те трябва да документират мерките, които предприемат за предотвратяване и управление на евентуални рискове от заболяване. С цел да се защити здравето на потребителите, производителите на аквакултури трябва да спазват строги правила относно хигиената на храните и здравето на животните. Те трябва да използват само разрешени и контролирани фуражи.
— За използването на ветеринарни лекарствени продукти се изисква рецепта от ветеринарен лекар и се разрешават само разрешени ветеринарни лекарствени продукти, като се спазват предписаните карентни срокове и граници на остатъчните количества. Производителите трябва да записват всички ветеринарни лекарства, които използват, и да съхраняват копия от рецептите.
— Освен това земеделските стопани трябва да гарантират хуманно отношение към селскостопанските животни през целия им производствен цикъл, както и по време на клането и транспортирането.