— Ennen kuin vesiviljelylaitokset voivat toimia, tulevien vesiviljelyalan tuottajien on saatava lupa toimivaltaisilta kansallisilta viranomaisilta (joskus alueviranomaiset voivat olla vastuussa luvista). Viranomaiset tarkastavat, onko laitoksen ehdotettu sijainti sopiva, ja selvittävät huolellisesti sen mahdolliset ympäristövaikutukset.
— Vesiviljelyalan tuottajat tarvitsevat luvan ennen kuin ne käyttävät viljelylaitoksessa merivettä tai makeaa vettä. Kun vesimuodostuma palaa ympäristöön, vesimuodostuman tila ei saa huonontua.
— Lisäksi vesiviljelypitopaikkojen on oltava eläinten terveyttä käsittelevien terveysviranomaisten rekisteröimiä tai hyväksymiä, ja sekä viljelijällä että näillä viranomaisilla on velvollisuus valvoa mahdollisia tauteja.
— Kun kaikki luvat on saatu, vesiviljelyalan tuottajien on täytettävä useita edellytyksiä sen varmistamiseksi, että vesiviljelytoiminnassa kunnioitetaan ympäristöä, ihmisten ja eläinten terveyttä ja eläinten hyvinvointia.
— Luvan saaneiden tilojen on edelleen seurattava ympäristövaikutuksiaan.
— Ympäristön suojelemiseksi tuottajat voivat käyttää ainoastaan hyväksyttyjä rehuja, puhdistusaineita ja lääkkeitä.
— Eläinten terveyden osalta viljelijöillä on myös velvollisuus pitää useita rekistereitä, mukaan lukien tiedot siitä, kuinka monta eläintä maatilalle saapuu ja sieltä poistuu ja kuinka monta ihmistä kuolee. Niiden on myös kirjattava toimenpiteet, joita ne toteuttavat ehkäistäkseen ja hallitakseen tautien riskiä. Kuluttajien terveyden suojelemiseksi vesiviljelyn harjoittajien on noudatettava tiukkoja elintarvikehygieniaa ja eläinten terveyttä koskevia sääntöjä. Ne saavat käyttää vain hyväksyttyä ja valvottua rehua.
— Eläinlääkkeiden käyttö edellyttää eläinlääkärin antamaa lääkemääräystä, ja ainoastaan myyntiluvan saaneet eläinlääkkeet ovat sallittuja noudattaen määrättyjä varoaikoja ja jäämien enimmäismääriä. Viljelijöiden on kirjattava kaikki käyttämänsä eläinlääkkeet ja säilytettävä lääkemääräysten jäljennökset.
— Lisäksi viljelijöiden on varmistettava tuotantoeläinten inhimillinen kohtelu koko tuotantosyklin ajan sekä teurastuksen ja kuljetuksen aikana.