— Zanim gospodarstwa akwakultury będą mogły prowadzić działalność, przyszli producenci akwakultury muszą uzyskać zezwolenie od właściwych organów krajowych (czasami organy regionalne mogą być odpowiedzialne za wydawanie zezwoleń). Dokonując oceny, organy te sprawdzają stosowność proponowanej lokalizacji oraz wnikliwie badają ewentualny wpływ zakładu na środowisko naturalne.
— Producenci akwakultury potrzebują zezwolenia przed wykorzystaniem wody morskiej lub słodkiej w gospodarstwie. Po powrocie do środowiska stan jednolitej części wód nie może ulec pogorszeniu.
— Ponadto zakłady akwakultury muszą być zarejestrowane lub zatwierdzone przez organy sanitarne zajmujące się zdrowiem zwierząt, a zarówno rolnik, jak i te organy mają obowiązek prowadzenia nadzoru nad możliwymi chorobami.
— Po uzyskaniu wszystkich autoryzacji producenci akwakultury muszą spełnić szereg warunków w celu zapewnienia poszanowania środowiska, zdrowia ludzi i zwierząt oraz dobrostanu zwierząt w działalności w zakresie akwakultury.
— Gospodarstwa posiadające zezwolenie muszą nadal monitorować ich wpływ na środowisko.
— W celu ochrony środowiska producenci mogą stosować wyłącznie dopuszczone pasze, środki czyszczące i leki.
— W odniesieniu do zdrowia zwierząt rolnicy mają również obowiązek prowadzenia kilku rejestrów, w tym dokumentacji dotyczącej liczby zwierząt wprowadzanych do gospodarstwa i opuszczających go oraz liczby zgonów. Muszą również prowadzić dokumentację środków, które wprowadzili w ramach zapobiegania wszelkiemu ryzyku choroby i zarządzania takim ryzykiem. Aby chronić zdrowie konsumentów, producenci akwakultury muszą przestrzegać restrykcyjnych przepisów dotyczących higieny żywności i zdrowia zwierząt. Dopuszczalne jest stosowanie wyłącznie zatwierdzonych pasz objętych kontrolą.
— Stosowanie weterynaryjnych produktów leczniczych wymaga recepty wystawionej przez lekarza weterynarii i dozwolone są jedynie dopuszczone weterynaryjne produkty lecznicze, z zachowaniem przepisanych okresów karencji i limitów pozostałości. Hodowcy muszą prowadzić dokumentację wszystkich weterynaryjnych produktów leczniczych, które stosują, oraz zachowywać kopie recept.
— Ponadto rolnicy muszą zapewnić humanitarne traktowanie zwierząt gospodarskich w całym cyklu produkcyjnym oraz podczas uboju i transportu.