Integrēta, daudzparametriska pieeja visaptverošam novērtējumam par mikrobu kvalitāti un piesārņojumu akvakultūras sistēmās

Tā kā pēdējo desmitgažu laikā akvakultūras nozare visā pasaulē ir ievērojami paplašinājusies, ilgtspējīgas akvakultūras koncepcija ir attīstījusies, ne tikai maksimāli palielinot ieguvumus, bet arī samazinot negatīvo ietekmi uz vidi, vienlaikus nodrošinot nodrošinātību ar pārtiku. Šajā sakarā viens no galvenajiem tematiem ir mikrobioloģiskā ūdens kvalitātes un dzīvnieku veselības uzraudzība un uzlabošana. Šajā pētījumā mēs vērtējām jūras ūdens mikrobioloģisko kvalitāti jūrkopības sistēmā, kas atrodas Vidusjūras piekrastes apgabalā (ZiemeļJonijas jūrā, Itālijā). Pirmo reizi mēs iesniedzām mikrobioloģisko inventarizāciju, kuras pamatā ir tradicionālās uz kultūru balstītās metodes, kas integrētas 16S rRNA gēnu metabarkodēšanas pieejā vibriozes identificēšanai un daudzveidības analīzēm un ko turpināja īstenot ar mikrobioloģiskiem metaboliskās profilēšanas datiem, kuri iegūti no Biolog EcoPlate sistēmas. Mikrobioloģiskā piesārņojuma rādītāji, vibriju daudzveidība un mikrobu metabolisms tika noteikti divos dažādos gada laikos (jūlijā un decembrī). Visi jūlijā izmērītie mikrobiālie parametri tika ievērojami palielināti salīdzinājumā ar decembrī izmērītajiem parametriem. Attiecībā uz zivju slimību un cilvēku infekciju risku tiek apspriesta potenciāli patogēnu vibriozes klātbūtne. Tādējādi šeit ierosinātais mikrobu uzskaitījums varētu būt jauna daudzparametriska pieeja piemērotai mikrobu kvalitātes uzraudzībai marikultūras sistēmā. Līdz ar to tas varētu būt noderīgs, lai nodrošinātu gan audzēto sugu, gan patērētāju drošību, ņemot vērā ilgtspējīgu un videi draudzīgu akvakultūras pārvaldību.