Integrirani, multiparametrijski pristup sveobuhvatnoj procjeni kvalitete mikroba i onečišćenja u sustavima akvakulture

S obzirom na to da se sektor akvakulture posljednjih desetljeća znatno proširio diljem svijeta, koncept održive akvakulture razvio se uz izazov povećanja koristi, ali i smanjenja negativnih učinaka na okoliš, istodobno osiguravajući sigurnost opskrbe hranom. U tom su okviru glavna tema praćenje i poboljšanje mikrobiološke kvalitete vode i zdravlja životinja. U ovoj smo studiji ocijenili mikrobiološku kvalitetu morske vode u marikulturnom sustavu koji se nalazi u mediteranskom obalnom području (Sjeverno Jonsko more, Italija). Prvi smo put dostavili mikrobni inventar utemeljen na konvencionalnim metodama koje se temelje na kulturi, integriran s pristupom genetskog metabarkodiranja 16S rRNA za analizu identifikacije vibriosa i raznolikosti te dodatno proveden s mikrobnim metaboličkim profiliranjem dobivenim iz sustava Biolog EcoPlate. Mikrobiološki pokazatelji onečišćenja, raznolikost vibriosa i mikrobni metabolizam utvrđeni su u dva različita doba godine (srpanj i prosinac). Svi mikrobni parametri izmjereni u srpnju znatno su povećani u usporedbi s onima izmjerenima u prosincu. O prisutnosti potencijalno patogenih vibriosa raspravlja se o riziku od bolesti riba i infekcija kod ljudi. Stoga bi ovdje predloženi mikrobni inventar mogao predstavljati novi multiparametrijski pristup za odgovarajući nadzor kvalitete mikroba u marikulturnom sustavu. Stoga bi to moglo biti korisno za jamčenje sigurnosti uzgajanih vrsta i potrošača s obzirom na održivo i ekološki prihvatljivo upravljanje akvakulturom.