Integračný, multiparametrický prístup ku komplexnému posudzovaniu mikrobiálnej kvality a znečisťovania v akvakultúrnych systémoch

Keďže odvetvie akvakultúry sa v posledných desaťročiach výrazne rozšírilo na celom svete, koncepcia udržateľnej akvakultúry sa vyvinula s výzvou nielen maximalizovať prínosy, ale aj minimalizovať negatívne vplyvy na životné prostredie, čím sa zároveň zabezpečí potravinová bezpečnosť. V tomto rámci je hlavnou témou monitorovanie a zlepšovanie mikrobiologickej kvality vody a zdravia zvierat. V tejto štúdii sme vyhodnotili mikrobiologickú kvalitu morskej vody v systéme morskej akvakultúry, ktorý sa nachádza v pobrežnej oblasti Stredozemného mora (Severné Iónske more, Taliansko). Po prvýkrát sme poskytli mikrobiálnu inventarizáciu založenú na konvenčných metódach založených na kultúre, integrovanú s prístupom metabardingu 16S rRNA pre identifikáciu vibrácií a analýzy rozmanitosti, a ďalej sme implementovali údaje o mikrobiálnom metabolickom profilovaní získané zo systému Biolog EcoPlate. Indikátory mikrobiologického znečistenia, rozmanitosť vibrácií a mikrobiálny metabolizmus boli stanovené v dvoch rôznych obdobiach roka (júl a december). Všetky mikrobiálne parametre namerané v júli sa v porovnaní s parametrami nameranými v decembri výrazne zvýšili. O prítomnosti potenciálne patogénnych vibrácií sa diskutuje v súvislosti s rizikom choroby rýb a infekcií u ľudí. Navrhovaná mikrobiálna inventarizácia by preto mohla predstavovať nový multiparametrický prístup k vhodnému dohľadu nad mikrobiálnou kvalitou v systéme morskej akvakultúry. Mohla by byť preto užitočná na zaistenie bezpečnosti chovaných druhov aj spotrebiteľov vzhľadom na udržateľné a ekologické riadenie akvakultúry.