Zintegrowane, multiparametryczne podejście do kompleksowej oceny jakości mikrobiologicznej i zanieczyszczenia w systemach akwakultury

Ponieważ w ostatnich dziesięcioleciach sektor akwakultury znacznie się rozwinął na całym świecie, koncepcja zrównoważonej akwakultury rozwinęła się wraz z wyzwaniem nie tylko maksymalizacji korzyści, ale również zminimalizowania negatywnego wpływu na środowisko, zapewniając jednocześnie bezpieczeństwo żywnościowe. W tym kontekście głównym tematem jest monitorowanie i poprawa jakości wody mikrobiologicznej oraz zdrowia zwierząt. W niniejszym badaniu oceniliśmy jakość mikrobiologiczną wód morskich w systemie marikulturowym zlokalizowanym na śródziemnomorskim obszarze przybrzeżnym (północne Morze Jońskie, Włochy). Po raz pierwszy przedstawiliśmy wykaz drobnoustrojów oparty na konwencjonalnych metodach opartych na kulturze, zintegrowany z metodą metabarkodowania genów rRNA 16S do identyfikacji vibrios i analiz różnorodności, a następnie wdrażany za pomocą danych profilowania mikrobiologicznego uzyskanych z systemu Biolog EcoPlate. Wskaźniki zanieczyszczenia mikrobiologicznego, różnorodność wibrriosa i metabolizm mikrobiologiczny określono w dwóch różnych porach roku (lipiec i grudzień). Wszystkie parametry mikrobiologiczne zmierzone w lipcu znacznie wzrosły w porównaniu z parametrami mierzonymi w grudniu. Omawia się obecność potencjalnie chorobotwórczych wibrriosów w odniesieniu do ryzyka chorób ryb i zakażeń u ludzi. W związku z tym proponowany tu wykaz mikroorganizmów może stanowić nowe wieloparametryczne podejście do odpowiedniego nadzoru jakości mikroorganizmów w systemie marikulturowym. W związku z tym mogłoby to być przydatne dla zapewnienia bezpieczeństwa zarówno hodowanych gatunków, jak i konsumentów w świetle zrównoważonego i przyjaznego dla środowiska zarządzania akwakulturą.