En integreret, multiparametrisk tilgang til den omfattende vurdering af mikrobiel kvalitet og forurening i akvakultursystemer

I takt med at akvakultursektoren er vokset betydeligt på verdensplan i de seneste årtier, har begrebet bæredygtig akvakultur udviklet sig med den udfordring ikke blot at maksimere fordelene, men også at minimere de negative indvirkninger på miljøet, samtidig med at fødevaresikkerheden sikres. Inden for disse rammer er overvågning og forbedring af den mikrobiologiske vandkvalitet og dyresundhed et centralt emne. I dette studie evaluerede vi den mikrobiologiske kvalitet af havvand i et havbrug beliggende i et middelhavskystområde (det nordlige Joniske Hav, Italien). Vi fremlagde for første gang en mikrobiel opgørelse baseret på konventionelle kulturbaserede metoder, der var integreret med 16S rRNA-genmetabarkodningstilgangen til vibriosidentifikation og mangfoldighedsanalyser, og som blev yderligere gennemført med mikrobielle metaboliske profileringsdata fra BioLog EcoPlate systemet. Mikrobiologiske forureningsindikatorer, vibriosediversitet og mikrobiel metabolisme blev fastlagt to forskellige tidspunkter af året (juli og december). Alle mikrobielle parametre målt i juli steg markant i forhold til dem, der blev målt i december. Tilstedeværelsen af potentielt patogene vibrioer drøftes vedrørende risikoen for fiskesygdomme og infektioner hos mennesker. Den her foreslåede mikrobielle opgørelse kan således udgøre en ny multiparametrisk tilgang til passende overvågning af den mikrobielle kvalitet i et havbrug. Det kunne derfor være nyttigt med henblik på at garantere sikkerheden for både de opdrættede arter og forbrugerne i lyset af en bæredygtig og miljøvenlig akvakulturforvaltning.