Μια ολοκληρωμένη, πολυπαραμετρική προσέγγιση για την ολοκληρωμένη αξιολόγηση της μικροβιακής ποιότητας και της ρύπανσης στα συστήματα υδατοκαλλιέργειας

Καθώς ο τομέας της υδατοκαλλιέργειας επεκτάθηκε σημαντικά παγκοσμίως τις τελευταίες δεκαετίες, η έννοια της βιώσιμης υδατοκαλλιέργειας αναπτύχθηκε με την πρόκληση όχι μόνο της μεγιστοποίησης των οφελών αλλά και της ελαχιστοποίησης των αρνητικών επιπτώσεων στο περιβάλλον, διασφαλίζοντας ταυτόχρονα την επισιτιστική ασφάλεια. Στο πλαίσιο αυτό, η παρακολούθηση και η βελτίωση της μικροβιολογικής ποιότητας των υδάτων και της υγείας των ζώων αποτελούν κεντρικό θέμα. Στην παρούσα μελέτη αξιολογήσαμε τη μικροβιολογική ποιότητα του θαλάσσιου νερού σε ένα σύστημα θαλασσοκαλλιέργειας που βρίσκεται σε μεσογειακή παράκτια περιοχή (Βόρειο Ιόνιο Πέλαγος, Ιταλία). Προσκομίσαμε, για πρώτη φορά, μικροβιακή απογραφή με βάση συμβατικές μεθόδους καλλιέργειας, η οποία ενσωματώθηκε στην προσέγγιση γονιδιακής μετα-κωδικοποίησης 16S rRNA για αναλύσεις ταυτοποίησης και ποικιλότητας vibrios, και εφαρμόστηκε περαιτέρω με μικροβιακά δεδομένα μεταβολικού προφίλ που λαμβάνονται από το σύστημα EcoPlate του BioLog. Οι δείκτες μικροβιολογικής ρύπανσης, η ποικιλότητα vibrios και ο μικροβιακός μεταβολισμός καθορίστηκαν σε δύο διαφορετικές περιόδους του έτους (Ιούλιος και Δεκέμβριος). Όλες οι μικροβιακές παράμετροι που μετρήθηκαν τον Ιούλιο αυξήθηκαν σημαντικά σε σύγκριση με εκείνες που μετρήθηκαν τον Δεκέμβριο. Η παρουσία δυνητικά παθογόνων vibrios συζητείται σχετικά με τον κίνδυνο ασθενειών των ψαριών και λοιμώξεων από τον άνθρωπο. Ως εκ τούτου, η προτεινόμενη μικροβιακή απογραφή θα μπορούσε να αποτελέσει μια νέα πολυπαραμετρική προσέγγιση για την κατάλληλη επιτήρηση της μικροβιακής ποιότητας σε ένα σύστημα θαλασσοκαλλιέργειας. Κατά συνέπεια, θα μπορούσε να είναι χρήσιμη για τη διασφάλιση της ασφάλειας τόσο των εκτρεφόμενων ειδών όσο και των καταναλωτών υπό το πρίσμα της βιώσιμης και φιλικής προς το περιβάλλον διαχείρισης της υδατοκαλλιέργειας.