En integrerad, multiparametrisk strategi för en övergripande bedömning av mikrobiologisk kvalitet och föroreningar i vattenbrukssystem

I takt med att vattenbrukssektorn har expanderat avsevärt över hela världen under de senaste årtiondena har begreppet hållbart vattenbruk utvecklats med utmaningen att inte bara maximera fördelarna utan också minimera de negativa miljöeffekterna, samtidigt som livsmedelstryggheten tryggas. I detta sammanhang är övervakning och förbättring av den mikrobiologiska vattenkvaliteten och djurhälsan en central fråga. I denna studie utvärderade vi havsvattnets mikrobiologiska kvalitet i ett havsodlingssystem i ett kustområde i Medelhavet (norra Joniska havet, Italien). Vi lade för första gången fram en mikrobiell inventering baserad på konventionella odlingsbaserade metoder, integrerad med metabarkodningsmetoden för 16S rRNA-genen för vibriosidentifiering och mångfaldsanalyser, och som genomfördes ytterligare med uppgifter om mikrobiell metabolisk profilering som erhållits från BioLog EcoPlate-systemet. Mikrobiologiska föroreningsindikatorer, vibriosmångfald och mikrobiell metabolism fastställdes vid två olika tidpunkter på året (juli och december). Alla mikrobiella parametrar som mättes i juli ökade markant jämfört med de parametrar som mättes i december. Förekomsten av potentiellt patogena vibrior diskuteras när det gäller risken för fisksjukdomar och infektioner hos människor. Den förteckning över mikroorganismer som föreslås här kan därför utgöra en ny multiparametrisk metod för lämplig övervakning av den mikrobiella kvaliteten i ett markodlingssystem. Det skulle därför kunna vara till nytta för att garantera säkerheten för både de uppfödda arterna och konsumenterna mot bakgrund av en hållbar och miljövänlig vattenbruksförvaltning.