Integracijski, multiparametrični pristop za celovito oceno mikrobne kakovosti in onesnaževanja v akvakulturi

Ker se je sektor akvakulture v zadnjih desetletjih močno razširil po vsem svetu, se je koncept trajnostne akvakulture razvil z izzivom ne le čim večjega povečanja koristi, temveč tudi čim večjega zmanjšanja negativnih vplivov na okolje, ki hkrati zagotavlja prehransko varnost. V tem okviru sta spremljanje in izboljšanje mikrobiološke kakovosti vode in zdravja živali osrednja tema. V tej študiji smo ocenili mikrobiološko kakovost morske vode v marikulturnem sistemu na sredozemskem obalnem območju (Severno Jonsko morje, Italija). Prvič smo zagotovili mikrobni popis, ki temelji na konvencionalnih metodah, ki temeljijo na kulturi, in je povezan s pristopom metabardiranja genov RNA 16S za identifikacijo vibriosov in analize raznolikosti ter se nadalje izvaja s podatki o mikrobiološkem presnovnem profiliranju, pridobljenimi iz sistema Biolog EcoPlate. Kazalniki mikrobiološkega onesnaževanja, raznolikost vibriosov in mikrobni presnova so bili določeni v dveh različnih obdobjih leta (julij in december). Vsi mikrobni parametri, izmerjeni julija, so se v primerjavi s parametri, izmerjenimi decembra, znatno povečali. O prisotnosti potencialno patogenih vibriosov se razpravlja v zvezi s tveganjem bolezni rib in okužb ljudi. Zato bi lahko predlagani mikrobni popis pomenil nov multiparametrični pristop za ustrezen nadzor mikrobne kakovosti v marikulturnem sistemu. Zato bi lahko bila koristna za zagotavljanje varnosti gojenih vrst in potrošnikov z vidika trajnostnega in okolju prijaznega upravljanja ribogojstva.