Integroitu moniparametrinen lähestymistapa vesiviljelyjärjestelmien mikrobiologisen laadun ja saastumisen kattavaan arviointiin

Vesiviljelyalan laajentuessa merkittävästi maailmanlaajuisesti viime vuosikymmeninä kestävän vesiviljelyn käsitteen haasteena on paitsi maksimoida hyödyt myös minimoida kielteiset ympäristövaikutukset ja varmistaa samalla elintarviketurva. Tässä yhteydessä keskeisenä aiheena on veden mikrobiologisen laadun ja eläinten terveyden seuranta ja parantaminen. Tässä tutkimuksessa arvioitiin meriveden mikrobiologista laatua Välimeren rannikkoalueella (Pohjois-Jonianmeri, Italia) sijaitsevassa meriviljelyjärjestelmässä. Toimitimme ensimmäistä kertaa mikrobi-inventaarion, joka perustuu perinteisiin viljelypohjaisiin menetelmiin ja joka on integroitu 16S-rRNA-geenin metabarkokoodausmenetelmään vibrioiden tunnistamista ja monimuotoisuutta koskevissa analyyseissä ja jota toteutetaan edelleen biolog EcoPlate -järjestelmästä saatujen mikrobiologisten metabolisten profilointitietojen avulla. Mikrobiologisen saastumisen indikaattorit, vibrioiden monimuotoisuus ja mikrobien aineenvaihdunta määritettiin kahdessa eri vaiheessa vuotta (heinä- ja joulukuussa). Kaikki heinäkuussa mitatut mikrobiparametrit kasvoivat huomattavasti verrattuna joulukuussa mitattuihin parametreihin. Mahdollisesti patogeenisten vibrioiden esiintymisestä keskustellaan kalatautien ja ihmisten tartuntojen riskistä. Näin ollen tässä ehdotettu mikrobi-inventaario voisi edustaa uutta moniparametrista lähestymistapaa mikrobien laadun asianmukaiseen seurantaan meriviljelyjärjestelmässä. Näin ollen siitä voisi olla hyötyä sekä kasvatettujen lajien että kuluttajien turvallisuuden varmistamisessa, kun otetaan huomioon kestävä ja ympäristöystävällinen vesiviljelyn hoito.