Integruotas, daugiaparametrinis akvakultūros sistemų mikrobų kokybės ir taršos akvakultūros sistemose visapusiško vertinimo metodas

Pastaraisiais dešimtmečiais akvakultūros sektorius gerokai išsiplėtė visame pasaulyje, todėl tvarios akvakultūros koncepcija buvo plėtojama siekiant ne tik kuo labiau padidinti naudą, bet ir kuo labiau sumažinti neigiamą poveikį aplinkai, kartu užtikrinant apsirūpinimo maistu saugumą. Atsižvelgiant į tai, viena iš pagrindinių temų yra mikrobiologinės vandens kokybės ir gyvūnų sveikatos stebėsena ir gerinimas. Šiame tyrime įvertinome jūros vandens mikrobiologinę kokybę Viduržemio jūros pakrantės zonoje (Šiaurės Jonijos jūroje, Italijoje) esančioje marikultūros sistemoje. Pirmą kartą pateikėme mikrobinę inventorizaciją, pagrįstą tradiciniais kultūra grindžiamais metodais, integruotą į 16S rRNA genų metabarkodavimo metodą vibrios identifikavimui ir įvairovės analizei ir toliau įgyvendinamą naudojant mikrobinio metabolinio profiliavimo duomenis, gautus iš Biolog EcoPlate sistemos. Mikrobiologinės taršos rodikliai, vibrioso įvairovė ir mikrobų metabolizmas buvo nustatyti dviem skirtingais metų laikais (liepos ir gruodžio mėn.). Palyginti su gruodžio mėn., visi liepos mėn. išmatuoti mikrobiniai parametrai gerokai padidėjo. Dėl galimo patogeninio vibrio buvimo aptariamas žuvų ligų ir žmonių infekcijų pavojus. Todėl siūloma mikrobų inventorizacija gali būti naujas daugiaparametrinis metodas tinkamai stebėti mikrobų kokybę marikultūros sistemoje. Todėl jis galėtų būti naudingas siekiant užtikrinti tiek auginamų rūšių, tiek vartotojų saugą, atsižvelgiant į tvarų ir ekologišką akvakultūros valdymą.