Comme toute activité économique, l’aquaculture a une incidence sur l’environnement. Cela dépend de la qualité de la gestion de l’activité, de l’adéquation de la localisation et du système de production. Lorsqu’elle est gérée correctement, l’aquaculture peut être une méthode de production de protéines à empreinte carbone et environnementale plus faible que d’autres types d’agriculture. Qui plus est, certaines formes d’aquaculture (par exemple, l’élevage de mollusques, l’aquaculture en étangs et dans des zones humides et la culture d’algues et d’autres invertébrés) peuvent offrir de nombreux services écosystémiques lorsqu’elles sont gérées de manière appropriée. Ces services comprennent l’absorption de l’excès de nutriments et de matières organiques dans l’environnement ou la conservation et la restauration des écosystèmes et de la biodiversité.
La législation environnementale de l’UE et la législation nationale de mise en œuvre ont établi le cadre réglementaire de l’aquaculture de l’UE qui garantit l’atténuation de l’incidence que les activités aquacoles peuvent avoir sur l’environnement (que ce soit en termes d’empreinte carbone, d’effluents, de déchets ou d’autres incidences sur les écosystèmes marins et d’eau douce) et que les activités aquacoles ne nuisent pas de manière significative aux écosystèmes ou à la biodiversité.
Les performances environnementales du secteur aquacole de l’UE peuvent néanmoins être encore améliorées par: I) veiller à ce que la législation environnementale soit pleinement appliquée et à ce que ses objectifs soient atteints; II) atténuer davantage les effets de l’aquaculture; et iii) promouvoir une aquaculture ayant une incidence moindre sur l’environnement et une aquaculture qui fournit des services écosystémiques.
Les «orientations stratégiques pour une aquaculture plus durable et compétitive dans l’Union européenne pour la période 2021-2030» visent à améliorer les performances environnementales du secteur aquacole en limitant davantage les incidences de l’aquaculture, ainsi qu’en promouvant les types d’aquaculture les plus bénéfiques pour l’environnement et le climat, tels que l’aquaculture à faible trophique et l’aquaculture biologique.