L’aquaculture nécessite une bonne qualité de l’eau afin de garantir la santé et le bien-être optimaux des animaux aquatiques ainsi que la rentabilité d’une exploitation aquatique. Par conséquent, la lutte contre la pollution de l’eau par les États membres de l’UE, conformément à l’ambition «zéro pollution» définie dans le pacte vert pour l’Europe, revêt une importance particulière pour l’aquaculture.
Les producteurs aquacoles ont besoin d’une autorisation avant d’utiliser de l’eau de mer ou de l’eau douce pour l’exploitation. Lorsqu’ils la remettent dans l’environnement, l’état de la masse d’eau ne doit pas se détériorer. Les rejets provenant des installations aquacoles de l’UE doivent respecter les normes strictes de l’UE en matière de qualité de l’eau ainsi que les réglementations nationales, régionales et locales strictes.
Certaines formes d’aquaculture telles que l’élevage de mollusques et l’élevage d’algues et d’autres invertébrés, lorsqu’elles sont gérées de manière appropriée, peuvent améliorer la qualité de l’eau grâce à l’absorption d’excédents de nutriments et de matières organiques dans l’environnement.